1、按用途可分为：小体积样品全自动固相萃取仪和大体积样品全自动固相萃取仪
小体积样品指食品、药品等样体，体积量一般在50ml以下;而大体样品主要指水样，一般是200ml量以上。市面上现有的全自动固相萃取仪也是通过样品量的体积不同而设计。
2、按原理分可分为柱萃取和膜萃取全自动固相萃取仪
膜萃取主要为大体积水样而设计的，膜萃取速度快是其优点，而且不容易堵塞，但是单个样品的处理成本较柱萃取高。
3、按通道分可分为单通道和多通道固相萃取仪
其中聚同电子系列的固相萃取仪分为普通固相萃取仪和全自动固相萃取仪，通道数普通固相分为12/24通道，全自动固相风味6/8通道
通常通道数量越多，在处理大批量样品时，就可以节约更多的时间，特别是上样的时间。